中醫(yī)屬于一種對(duì)偶性哲學(xué)，其基礎(chǔ)是陰陽(yáng)對(duì)偶學(xué)說(shuō)，而陰陽(yáng)交變之代數(shù)本質(zhì)，就是二進(jìn)制的0與1互相生化、代替、疊加、消長(zhǎng)之結(jié)果?！饵S帝內(nèi)經(jīng)·素問(wèn)·陰陽(yáng)離合論篇第六》曰：
陰陽(yáng)者，數(shù)之可十，推之可百；數(shù)之可千，推之可萬(wàn)。萬(wàn)之大不可勝數(shù)，然其要一也。……知其要，一言而終；不知其要，流散無(wú)窮。
從中醫(yī)之研究方法與世界觀來(lái)看，中醫(yī)就是建立于陰陽(yáng)五行學(xué)之上的一門哲學(xué)，而超出了科學(xué)之范疇。
《易·系辭下》曰：
古者包犧氏之王天下也，仰則觀象于天，俯則觀法于地，觀鳥(niǎo)獸之文與地之宜，近取諸身，遠(yuǎn)取諸物，于是始作八卦，以通神明之德，以類萬(wàn)物之情。
包犧氏即伏羲氏，傳說(shuō)其根據(jù)天地間之自然規(guī)律，觀測(cè)自身與身外之物創(chuàng)立了先天八卦，可說(shuō)是參性命之理，寓養(yǎng)生之道。這種“近取諸身，遠(yuǎn)取諸物”之實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｊ剑沟弥袊?guó)傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)之實(shí)驗(yàn)方式以內(nèi)證為主，而非解剖小白鼠那樣的西醫(yī)器械式。
內(nèi)證，即向內(nèi)（自身）求證。據(jù)《道藏》記載，中國(guó)古代的修道者修到相當(dāng)高之程度后，便能在靜坐之時(shí)，看出自身之經(jīng)絡(luò)、脈理、穴道以及血液運(yùn)行之線路，因此他們能夠創(chuàng)立脈絡(luò)學(xué)說(shuō)與針灸術(shù)，并最終形成中醫(yī)體系。中醫(yī)的始祖之一是黃帝，而黃帝又被道教奉為三祖之一（另二祖為老子與張道陵），因此，也可以認(rèn)為中醫(yī)起源于“道”。
相比較而言，西醫(yī)屬于科學(xué)，其目的是為了促進(jìn)技術(shù)，西醫(yī)實(shí)驗(yàn)依賴儀器，離開(kāi)了儀器其很難發(fā)展。而內(nèi)證式的中醫(yī)實(shí)驗(yàn)依靠?jī)?nèi)觀反視，需要學(xué)習(xí)者有很強(qiáng)的歸納、抽象與推理能力，這就好比數(shù)學(xué)，有紙筆就夠了。中醫(yī)學(xué)者劉力紅認(rèn)為，西醫(yī)的教育方式是在學(xué)校里復(fù)制“產(chǎn)品”，故社會(huì)上西醫(yī)盛行；而中醫(yī)教育只適合門派式之師徒傳承，強(qiáng)制要建立中醫(yī)學(xué)院甚至大學(xué)，似乎有違中醫(yī)門庭文化的發(fā)展之道。此外，中西醫(yī)之區(qū)別還可以用“心境”一詞來(lái)詮釋。心是主體的，是主觀意識(shí)；而境是客體的，是客觀環(huán)境。因此，“心境”合璧就含有主觀意識(shí)對(duì)客觀世界、客觀環(huán)境所作出之反應(yīng)。對(duì)科學(xué)史稍作了解就可發(fā)現(xiàn)，產(chǎn)生于西方之近現(xiàn)代科學(xué)，幾乎都致力于對(duì)“境”之改變，并相信“境”對(duì)“心”有絕對(duì)影響力；而東方之智者們，卻將其絕大多數(shù)努力放在對(duì)“心”之修煉上。儒、釋、道之學(xué)問(wèn)無(wú)不強(qiáng)調(diào)內(nèi)環(huán)境，因?yàn)閮?nèi)因才是根本，是變化之根據(jù)，而外因是變化之條件。對(duì)于條件，能夠接受甚或忍受，這就行了。圣人講知足常樂(lè)，就是強(qiáng)調(diào)修心。
《易經(jīng)·系辭上》曰：
形而上者謂之道，形而下者謂之器。
中醫(yī)是形而上的，是道；西醫(yī)是形而下的，是器。所以中醫(yī)不靠工具，而西醫(yī)必須使用工具。中醫(yī)認(rèn)為：“氣聚而有形?！毙味聞t構(gòu)成有質(zhì)量、有體積之實(shí)在器物。而氣在聚合之前，卻處于無(wú)形之狀態(tài)。可見(jiàn)，現(xiàn)代科學(xué)所討論之領(lǐng)域，實(shí)際上都是氣聚合以后的形而下之領(lǐng)域。
《黃帝內(nèi)經(jīng)·素問(wèn)·八正神明論篇第二十六》曰：
上工救其萌牙，必先見(jiàn)三部九候之氣，盡調(diào)不敗而救之，故曰上工。下工救其已成，救其已敗。
《黃帝內(nèi)經(jīng)·靈樞·九針十二原第一》曰：
粗守形，上守神。神乎神，客在門。
上指良醫(yī)，粗指庸醫(yī)。神是無(wú)形的，是形而上之道；而形是形而下之身體。因此，會(huì)“治病”的醫(yī)生都是下工，是庸醫(yī)。在疾病未成形之前就將其消滅，只有上工才做得到。良醫(yī)是守神的，而不單單是治病的。守神就是治未病，即未成形之病。同理，良師應(yīng)該是傳道的，而不單單是解惑的。
關(guān)于內(nèi)證式研究方式，作者再多講一些?！队钪鏄O問(wèn)——量子、信息和宇宙》一書在第五章中道：
惠勒教授在討論量子力學(xué)基礎(chǔ)時(shí)，多次利用了思想實(shí)驗(yàn)的方法，這個(gè)美妙的傳統(tǒng)可追溯到量子力學(xué)的誕生之日，海森堡就曾提出伽馬射線顯微鏡的概念。在波爾和愛(ài)因斯坦的爭(zhēng)論中，思想實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用更是到達(dá)頂峰。
此外，該書其他章節(jié)仍有思想實(shí)驗(yàn)之話題，如第八章等。該書是一本論文集，用以紀(jì)念美國(guó)著名物理學(xué)家惠勒（Wheeler，1911-2008年）教授或試圖解答其曾提出的關(guān)于量子與信息等高端難題。全書共分十四章，分別來(lái)自當(dāng)代歐美大學(xué)之著名學(xué)者（以研究量子力學(xué)為主）。從上述引文可見(jiàn)，歐美不少著名學(xué)者從狹義相對(duì)論產(chǎn)生之二十世紀(jì)初開(kāi)始，似乎越來(lái)越認(rèn)同內(nèi)證式的思想實(shí)驗(yàn)。實(shí)際上，由于現(xiàn)代高科技基本上離不開(kāi)現(xiàn)代數(shù)學(xué)，而現(xiàn)代數(shù)學(xué)之抽象，使得整本數(shù)學(xué)書中唯有的數(shù)碼只怕就剩下頁(yè)碼而已！如此高度之抽象，想要實(shí)證，是很困難的。這只怕正是當(dāng)代前沿科學(xué)家、物理學(xué)家親睞于內(nèi)證式思想實(shí)驗(yàn)之根本原因。
內(nèi)證式的思考絕不落后，也不會(huì)過(guò)時(shí)。在此介紹一則惠勒教授之軼事，以為補(bǔ)充。1981年，惠勒訪問(wèn)中國(guó)，并觀賞了舞劇《鳳鳴岐山》。其中，惠勒了解到姜子牙揮舞著指揮一切的“無(wú)”字旗之含義為“Nothing”時(shí)，顯得十分興奮，認(rèn)為這正與其所倡導(dǎo)之“質(zhì)樸性原理”相合。更令其吃驚的是，翻譯告訴他，老子《道德經(jīng)》早就說(shuō)過(guò)：“天下萬(wàn)物生于有，有生于無(wú)。”惠勒聽(tīng)后感慨道：
現(xiàn)代物理學(xué)大廈就建立在一無(wú)所有之上，從一無(wú)所有導(dǎo)出了現(xiàn)在的所有，沒(méi)想到的是，近代西方歷經(jīng)數(shù)代花費(fèi)大量物力財(cái)力才找到的結(jié)論，在中國(guó)的遠(yuǎn)古早已有了思想的先驅(qū)。
由于震驚于中國(guó)古人之哲學(xué)觀，惠勒對(duì)中國(guó)人充滿了好感，他在中國(guó)演講中鼓勵(lì)臺(tái)下的中學(xué)生道：“我想在你們中間會(huì)出現(xiàn)這樣的人，他們的偉大發(fā)現(xiàn)將超過(guò)波爾與愛(ài)因斯坦。物理學(xué)并沒(méi)有結(jié)束，它正在開(kāi)始。”偉大的思想總是驚人地相似，丹麥物理學(xué)家波爾（Bohr，1885-1962年）也將太極圖作為家族徽章，而分析心理學(xué)之創(chuàng)始人榮格曾在《現(xiàn)代人的精神問(wèn)題》一文中說(shuō)道：
東方的典籍在10個(gè)世紀(jì)之前就向我們介紹了哲學(xué)上的相對(duì)主義，而新近才在西方開(kāi)張的非決定論思想，卻正是中國(guó)古代科學(xué)的基礎(chǔ)。
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