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科研 | Nature 子刊:病原真菌調(diào)控小麥代謝組,誘導系統(tǒng)易感性,改變?nèi)~片微生物組

編譯:李菲,編輯:Emma、江舜堯。

原創(chuàng)微文,歡迎轉(zhuǎn)發(fā)轉(zhuǎn)載。

導讀

葉枯病菌Zymoseptoria tritici是小麥生產(chǎn)的嚴重威脅。目前對這種真菌與小麥相互作用的機制知之甚少。這篇論文通過共同感染測定、比較代謝組學和微生物組分析,揭示了易感和抗病小麥與Z. tritici的互作機理。結(jié)果證明,Z. tritici能夠減少易感小麥品種葉片中免疫相關(guān)代謝物質(zhì)的含量。而且,這種免疫抑制的能力并不局限在被侵染的葉片內(nèi),還擴散到同一植株的其它葉片上。作者稱這種現(xiàn)象為“系統(tǒng)誘導敏感性”。通過比較代謝組學的方法,作者確定了與Z. tritici抗性相關(guān)的代謝物質(zhì)合成途徑,發(fā)現(xiàn)其分別在易感和抗性小麥品種中被抑制和誘導。葉片微生物組分析表明,真菌誘導的代謝變化與小麥葉片微生物組的變化相關(guān)。


論文ID


原名:A fungal pathogen induces systemic susceptibility and systemic shifts in wheat metabolome and microbiome composition
譯名:原真菌調(diào)控小麥代謝組,誘導系統(tǒng)易感性,改變?nèi)~片微生物組
期刊:Nature Communications
IF:12.121
發(fā)表時間:2020.04
通訊作者:Eva H. Stukenbrock
通訊作者單位:德國馬普進化生物學研究所

實驗設計

實驗結(jié)果

1. 兩個小麥品種對Z. tritici的抗性不同

研究使用易感小麥品種Obelisk和抗性品種中國春。使用的葉枯病病菌為Z.tritici IPO323菌株(圖1A,B)。

圖1 Obelisk和中國春小麥品種對Z. tritici的抗性表型
 a. Z. Tritici侵染21天后葉片上每平方厘米的孢子數(shù)目。b. Z. Tritici侵染21天后被病灶覆蓋的葉面積的百分比。c.丁香假單胞菌菌株對Obelisk和中國春小麥品種的侵染情況(0天和4天)。

2. 易感小麥中,Z.tritici侵染促進細菌感染

目前尚無針對六倍體小麥的免疫標記,缺乏準確度量小麥免疫反應的技術(shù)手段。因此,作者開發(fā)了一種基于細菌感染的新檢測方法,衡量小麥的免疫反應程度,以便觀測Z. tritici侵染是否抑制感病小麥的免疫反應,促進細菌對小麥的感染。所使用的細菌菌株是病原細菌丁香假單胞菌菌株P(guān)or36、Pst DC3000和PsmES4326。Obelisk和中國春對Z.tritici的抗性不同,但兩個品種對這幾種丁香假單胞菌病原體的敏感性和抗性程度相同(圖1c)。
為了評估Z. tritici侵染對小麥免疫反應的影響,接種真菌孢子4天后,作者在Obelisk和中國春的3種葉片位置接種丁香假單胞菌Por和Pst菌株:1)在與真菌侵染的相同位置(Local co-infection),(2)在同一片葉子上真菌感染的相鄰的位置(Adjacent co-infection),(3)在被真菌感染的葉子以外的葉子上(Systemic co-infection)。作者預測Z. tritici能有效抑制Obelisk小麥的免疫反應,從而促進丁香假單胞菌的生長。
Obelisk小麥中,與對照相比,Z. tritici和Por細菌在同一位置的共感染增加了細菌的生長(圖2a)。與此相反,中國春小麥葉片上,Z. tritici和Por在同一位置的共感染減少了細菌的生長(圖2a)。
在葉片同一位置共感染不能排除真菌與細菌直接的相互作用。因此,觀測葉片上真菌侵染位置的鄰近區(qū)域,或其它葉片上的細菌生長,更能說明問題。Obelisk小麥中,真菌感染促進了鄰近區(qū)域的細菌生長。中國春中,真菌感染抑制鄰近區(qū)域的細菌生長(圖2b,c)。加熱殺死的Z. tritici孢子,沒有在Obelisk小麥中誘導或在中國春中抑制鄰近區(qū)域的細菌生長的能力(圖2b,c)。
使用真菌感染第二葉子,用Por接種第三片葉子時,易感品種Obelisk小麥中的細菌生長增加而抗性品種中國春的細菌生長減少。作者稱這一現(xiàn)象為“系統(tǒng)誘導性敏感(Systemic Induced Susceptibility)”。


圖2 Z.tritici感染小麥會改變感染位置和植株其它葉片對細菌病原體的抗性

Obelisk小麥(橙色/棕色),中國春(淺綠/綠色),Z. tritici 侵染(Zt),Z. tritici 侵染4天后,在侵染位置(Local, a)或侵染位置附近(Adjacent, b, c)或其它葉片(Systemic, d)共感染丁香假單胞菌Por或Pst菌株,4天后對細菌生長進行定量測量。

3. Z. tritici侵染改變小麥代謝組 

Obelisk和中國春之間的哪些生理差異導致了對Z. tritici的不同反應?作者使用FT-ICR-MS,對Z. tritici侵染4和8天后的葉片侵染位置和臨近區(qū)域進行廣泛靶向代謝組分析。

作者從三個角度分析代謝組變化。(1)品種比較,Obelisk與中國春的數(shù)據(jù)進行比較(相同處理,相同葉片位置)。(2)位置比較,侵染位置與相鄰未侵染位置的數(shù)據(jù)進行比較(相同處理,相同品種)。(3)處理比較,Z. tritici侵染的樣品與對照處理的樣品進行比較(相同品種,相同葉片位置)。

作者確定了116個帶注釋的代謝物,在至少1個角度的比較中有顯著差異,將這些代謝物稱為差異累積代謝物(Differentially Accumulating Metabolites, DAM)。


圖3 Z. tritici 侵染改變了苯并惡唑嗪酮類(benzoxazinoids, BXs)代謝物質(zhì)合成途徑相關(guān)物質(zhì)的含量

圖4 Z. tritici 侵染改變了苯丙素類(phenylpropanoids)代謝物質(zhì)合成途徑相關(guān)物質(zhì)的含量

4. Z. tritici以免疫相關(guān)的生物合成途徑為調(diào)控目標

作者研究了Z. tritici誘導的免疫相關(guān)代謝產(chǎn)物生物合成途徑的變化。作者重點研究了在其他植物系統(tǒng)中研究過的兩種生物合成途徑:苯并惡唑嗪酮類(benzoxazinoids, BXs)和苯丙素類(phenylpropanoids)。

BXs是一組植物抗病相關(guān)化合物。BX以非活性糖苷的形式存儲,在需要時以游離BX的形式釋放。Z. tritici侵染4天和8天后,中國春中,真菌侵染位置積累游離BX(圖3),在鄰近的不與真菌病原體直接接觸的位置積累無活性的BX糖苷(圖3d)。相比之下,Obelisk被Z. tritici.侵染后不會累積游離或存儲形式的BX。

苯丙素類是一大類植物酚類次生代謝產(chǎn)物。許多逆境誘導的苯丙素類化合物被認為是針對病原體的植物抗毒素。代謝組學比較分析表明,Z.tritici對苯丙素類化合物和從該途徑衍生的化合物(如肉桂酸酰胺(HCAAs)和類黃酮)的生物合成具有很強的調(diào)控作用(圖4)。Z. tritici侵染4天和8天后,中國春葉片的侵染位置和鄰近葉片組織中,發(fā)現(xiàn)高水平的羥基或糖苷化的肉桂醇。(羥基)肉桂醇是木質(zhì)素的前體,因此作者測量了Z.tritici感染之前和感染三天后Obelisk和中國春葉片中木質(zhì)素的含量。隨著葉片的生長,對照處理的葉片中的木質(zhì)素含量在兩個品種中均增加。然而,感染了Z.tritici的中國春葉中木質(zhì)素含量增加,而感染了Z.tritici的Obelisk葉中木質(zhì)素含量降低(補充材料中的圖片)。這表明,Z.tritici抑制了易感宿主Obelisk中免疫相關(guān)的細胞壁增強。

總之,中國春和Obelisk小麥品種對Z. tritici侵染的反應和免疫相關(guān)途徑的調(diào)控有明顯差異。免疫相關(guān)的代謝物質(zhì)通常在抗性品種中國春的真菌感染部位和鄰近組織中上調(diào)。Z. tritici可以調(diào)控易感小麥品種Obelisk中植物防御反應的化合物的生物合成途徑和積累。


圖5 Z. tritici 侵染改變了侵染位置和臨近葉片組織的葉片微生物組結(jié)構(gòu)

5. Z. tritici侵染與葉片微生物組的系統(tǒng)性變化相關(guān)

上述結(jié)果表明,Z.tritici抑制易感小麥中與免疫相關(guān)的生物合成途徑。此外,在抗性和易感小麥中,Z.tritici對免疫系統(tǒng)的調(diào)控對丁香假單胞菌在感染位置和植株其它葉片上的生長都有影響。那么,Z.tritici侵染是否影響改變感染位置和鄰近葉片組織中微生物的組成和結(jié)構(gòu)?

作者對葉片中的細菌群落(16S rDNA的V5—V7區(qū)域)進行測序,獲得3139個細菌操作分類單元(OTU)。在中國春中,真菌感染位置葉片組織以及鄰近葉片組織的群落豐富度顯著降低。相反,真菌感染對易感品種Obelisk的感染位置或鄰近葉片區(qū)域的細菌群落組成沒有顯著影響(圖5a)。

主坐標分析顯示,Z.tritici侵染導致中國春和Obelisk葉片侵染位置和其附近組織中,細菌的群落結(jié)構(gòu)發(fā)生變化(圖5b)。

這些數(shù)據(jù)表明,在抗性小麥品種中國春中,Z.tritici感染早期強烈改變了葉片中細菌群落結(jié)構(gòu)。作者推測這是免疫相關(guān)代謝產(chǎn)物上調(diào)和植物體系統(tǒng)誘導抗性的間接作用。


圖 6 Z.tritici侵染促進Z.tritici孢子在整個植株的侵染

6. 系統(tǒng)誘導性敏感可能會促進Z.tritici的傳播

Z.tritici侵染引起的植株系統(tǒng)誘導性敏感是否會促進新的Z.tritici孢子對小麥的感染?為了檢驗這個假設,作者在Obelisk植株第二片葉感染Z. tritici 4天后,用Z. tritici孢子侵染第三片葉。

作者使用定量PCR方法對第三葉片中的真菌生物量進行了定量。此外,作者還量化了第二和第三片葉子中葉片壞死和真菌孢子的量。第三葉片的真菌量因第二片葉子的感染而增加,但和對照間的數(shù)據(jù)差異并不顯著(圖6b,c)。

討論

系統(tǒng)獲得性抗性(Systemic Acquired Resistance, SAR),是指病菌感染部位會產(chǎn)生免疫信號,提高植株其它部位對病原體的抗性。本文中,作者證明,病原菌可以操控、抑制植物的免疫系統(tǒng),使植物的其它部位對病菌更敏感,作者將這種新現(xiàn)象稱為“系統(tǒng)誘導性敏感(Systemic Induced Susceptibility)”。

這種“系統(tǒng)誘導性敏感”可能是促進新的Z. tritici孢子感染的機制。作者的發(fā)現(xiàn)說明,我們需要重視病菌侵染過程中植物代謝組、微生物組的復雜交互作用。這一領(lǐng)域的進一步研究,對于開發(fā)基于植物益生菌的作物保護策略至關(guān)重要。

原文鏈接:  https://www.nature.com/articles/s41467-020-15633-x


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