LCMS是有機合成中重要的分析工具，解析LCMS譜圖也是一項基本技能。
1）LCMS的特性：是HPLC和MS的結合，有兩者的功能，有沒有兩者精確。
2）流動相方法：常見0-30，0-60，10-80，30-90四種方法，0，10，30都是指乙腈的含量，乙腈含量越大，流動相極性越小，出峰越靠前。
3）正離子源適用于堿性化合物：含氮化合物更容易粘附氫正離子，在正離子源中容易出分子離子峰。負離子源適合酸性化合物：酸性化合物更容易轟擊掉氫正離子，如酸，酚類化合物。
1）先看MS部分, 看有沒有所要離子峰, 并且要看清楚該化合物是否有MS信號, 是否掩蓋周圍的峰。
2)再看HPLC部分, 看含量有多少, 并且要看清楚該化合物是否有強的HPLC信號, 是否掩蓋周圍的峰。
3) 兩者結合起來看, 推測反應進行的程度和反應產(chǎn)生的雜質(zhì)。
[M+Na]+ = [M+23]+ 加鈉離子；
[M+K]+ = [M+39]+加鉀離子；
[M+NH4]+ = [M+18]+加銨離子；
[M +H +H2O]+ = [M+19]+加水；
[M+X]+ 這里X 是指溶劑緩沖液中的陽離子；
[M+H+Solvent]+溶劑加合峰，如[M+H+CH3CN]+ = [M+42 ]+ 是CH3CN加合離子，[M+H+CH3OH]+ = [M+33 ]+ 是CH3OH加合離子；
減峰：M-56(脫叔丁基）和M-100(脫Boc)，M-16（脫NH3)和M-17（脫水）以及M+2/2（比較常見），其他少見。
特別注意精確分子量和摩爾分子量的區(qū)別
常見氯和溴同位素的表現(xiàn): 一個氯峰高比M+2/M=1:3;一個溴為峰高比M+2/M=1:1；多個同位素的表現(xiàn)可以用Chemdraw精確模擬。
1.在LCMS報告中， MS響應強的組分有可能掩蓋MS響應弱的組分，可通過提取離子流或扣除背景等方式進行判斷，LCMS報告必須將LC和MS兩部分結合，相互佐證。
2.在不使用TLC，直接使用LCMS監(jiān)測反應時，必須結合其他手段（如：NMR）進行輔助檢測。特別提示：監(jiān)測反應，不能僅僅依賴于LCMS，而不點TLC板。監(jiān)測反應的手段，以TLC的使用最為重要，直接、快捷、并為后續(xù)的分離純化提供大量信息。
1.M+和（M＋1）+的問題：從理論上來講，ESI在正模式下只會出現(xiàn)加合離子（M＋H、M＋Na等），APCI和APPI可能出現(xiàn)M＋離子，但在實際工作中（LC－MS），可能會遇到M＋離子，如果化合物是沒有問題的，而M＋則是在質(zhì)譜過程中產(chǎn)生的。這類化合物的特點就是在結構中含有橋環(huán)，且在橋環(huán)中含有帶一個H的氮。私下里覺得是在電場作用下，橋環(huán)中的氮中性丟失質(zhì)子（H）所產(chǎn)生的，而M＋為（M－H＋1）＋。
2.M+Na的問題：對于一些樣品，只有M＋Ma，而幾乎沒有M＋1。該類化合物的特點是：化合物結構中含有多個O 和（或）S 原子。 色譜純的乙腈質(zhì)量上是沒的說的，但是，色譜純的溶劑中仍然含有痕量的堿金屬離子。即使在樣品處理中沒有引入堿金屬離子的鹽，溶劑中存在的痕量堿金屬離子會使質(zhì)譜上會出現(xiàn)加堿金屬離子的加合離子，這就是在質(zhì)譜上會出現(xiàn)M＋Na的原因；由于在化合物中O、S 原子還有未配對的孤對電子，而Na離子有沒有電子的空軌道，所以O、S 特別容易捕獲Na離子而形成帶電粒子， 當樣品含有多個O、S 的時候，形成M＋Na 峰的幾率增加，M＋H峰的比例逐漸減少甚至消失。
3.2M 峰和雙電荷離子：一般樣品是出M＋1（或23），隨著樣品濃度的增加，2M＋1（或23）豐度隨之增加，這主要是樣品濃度增高時，ESI噴霧中樣品濃度增大，在 后面的庫侖爆炸和進一步的去溶劑化過程中，最后兩個分子和一個電荷在一起的概率增大造成的。
對于雙電荷離子，主要是分子結構中有兩個質(zhì)子化位點，最后兩個位點都帶了一個電荷，最后形成了雙電荷離子。在ESI時，噴針和儀器組成了一個原電池， 流動相和噴針表面發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移，使得噴出來的霧滴帶電荷，而在噴霧過程的逆流N2的作用下，帶電液滴發(fā)生一級一級的庫侖爆炸（大部分液滴以廢液和氣態(tài) 被除去），在最后的去溶劑化后就形成了被檢測離子。所以樣品只有帶電，同時 在庫侖爆炸中優(yōu)先激發(fā)出來，才能形成檢測離子。這主要是考慮的溶劑化學的影 響，而且基質(zhì)的存在很可能會抑止樣品的離子化（基質(zhì)效應）。而APCI的流動 相在噴霧后，流動相被吹干后，樣品分子通過電暈放電針來帶電荷（另外，還可 能發(fā)生電荷交換）。電暈放電針的參數(shù)對樣品電離有影響，而基質(zhì)效應影響很小。
4.弱極性樣品離子化問題：極性偏低建議采用APCI（大氣壓化學電離）或APPI（大氣壓光致電離）源。 一般酸性化合物流動相中加鹽：如甲酸銨、乙酸銨，或堿（氨水）來增強化合物酸，以增強化合物的離子化，一般用正離子方式檢測。
文章來源：有機人名反應
