隨便截一些藥物，你是不是很熟悉呢哈
IC50，半抑制濃度，即凋亡細胞與全部細胞數(shù)之比等于50%時所對應(yīng)的藥物濃度。用來衡量藥物誘導(dǎo)凋亡的能力，誘導(dǎo)能力越強，該數(shù)值越低。也反向說明某種細胞對藥物的耐受程度。pRRophetic算法根據(jù)GDSC細胞系表達譜和TCGA基因表達譜構(gòu)建嶺回歸模型預(yù)測藥物IC50。
我們平臺IC50工具根據(jù)目前最大的公開藥物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫癌癥藥物敏感性基因組學(xué) (GDSC)，基于樣本轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)通過 pRRophetic算法預(yù)測每個樣本的藥物治療反應(yīng)。 當(dāng)前可分析2014和2016兩個不同時間段GDSC所收錄的藥物信息，其中2014共收錄138種藥物，2016共收錄251種藥物信息。（由于二者使用表達數(shù)據(jù)有差異，所以同一種藥物不同時間版本預(yù)測結(jié)果略有差異）
這里我們提供兩種結(jié)果展示形式：箱線圖和相關(guān)性。箱線圖即為不同樣本間的IC50分布；相關(guān)性則為某個基因或模型評分與IC50的關(guān)系。
諜照篇：
目前GDSC已經(jīng)收錄500多種藥物，但pRRophetic包目前停留在16年的251種藥物，這里我們將藥物增加到345種，例如ARRY-520。
好了，今天就介紹到這里，大家就趕緊去試試吧
