蒙哥折戟釣魚城，不久去世后，他的三個弟弟忽必烈、旭烈和阿里不哥成了汗位的直接繼承人選。
1256年，旭烈遠離蒙古就任波斯汗后，真正的爭奪者只剩下了忽必烈和阿里不哥兩位。阿里不哥作為拖雷幼子，已經(jīng)統(tǒng)治著蒙古的本土，并且在哈拉和林扎營。
而身為蒙古的統(tǒng)治者，他準(zhǔn)備在蒙古召開庫里勒臺，以確保自己能夠被選舉為大汗。但忽必烈搶先了一步，他從武昌返回中蒙邊界的上都府建立了大本營。
1260年6月4日，忽必烈被自己的黨羽擁立為大汗，這年他44歲。
按照成吉思汗法律，大汗必須由蒙古召開的庫里勒臺大會選舉產(chǎn)生，需得到到會蒙古各宗王的同意。
因此，忽必烈的當(dāng)選并非是正式的。而鑒于此，阿里不哥在蒙哥丞相勃魯合的慫恿下在哈拉和林另起爐灶，自封為大汗，他還爭取到了占領(lǐng)陜西和四川的蒙軍將領(lǐng)們的支持。
但是不久，這些地方的支持者突然都倒戈到了忽必烈一邊——忽必烈的副將們在甘州東部擊敗這些支持阿里不哥的軍隊。
這次的勝利鞏固了忽必烈對蒙古統(tǒng)治下的所有權(quán)。
緊接著，忽必烈又將自己的優(yōu)勢趁勢向蒙古推進。
1260年底，他進駐哈拉和林南的翁金河畔，而阿里不哥朝葉尼塞河上游撤退。忽必烈認為戰(zhàn)爭已經(jīng)結(jié)束，便在哈拉和林留下一小撮人馬后回到中原。
1261年年底，阿里不哥重新卷土而來，驅(qū)逐了忽必烈留在哈拉和林的守軍，并且和忽必烈在戈壁邊上交戰(zhàn)。忽必烈雖然獲勝，但他錯誤地估計了當(dāng)時的形勢，沒有進一步追擊，從而給對手留下了喘息之機。
10天后，在窩闊臺家族的首領(lǐng)海都和察合臺宗王阿魯忽的支持下，阿里不哥卷土重來，雙方展開了激戰(zhàn)，勝負難分。
1262年底，支持阿里不哥的察合臺宗王阿魯忽倒戈，致使局勢陡變。
阿里不哥在忽必烈軍隊的猛烈攻打下被迫撤出哈拉和林，在伊犁河流域與阿魯忽交戰(zhàn)。
1264年，腹背受敵的阿里不哥投降。
忽必烈雖然是赦免了他，但是處死了他的一些親信，首當(dāng)其沖的是就是原丞相李魯合。
而阿里不哥在忽必烈的囚禁下度過了余生，直到1266年去世。
