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研究發(fā)現(xiàn)組氨酸調(diào)控蛋白多肽淀粉樣組裝并賦予其納米酶活性

來源:生物物理所 2023-09-25 11:19

生物大分子自組裝成超分子結構后會產(chǎn)生重要功能,這與生命系統(tǒng)中的生理或病理狀態(tài)相關。蛋白質(zhì)和多肽組裝成淀粉樣纖維的行為已被認為與神經(jīng)退行性疾病密切聯(lián)系。淀粉樣蛋白組裝體具有相似的交叉β結構,其

生物大分子自組裝成超分子結構后會產(chǎn)生重要功能,這與生命系統(tǒng)中的生理或病理狀態(tài)相關。蛋白質(zhì)和多肽組裝成淀粉樣纖維的行為已被認為與神經(jīng)退行性疾病密切聯(lián)系。淀粉樣蛋白組裝體具有相似的交叉β結構,其中β鏈片段垂直于長纖維排列。這種類型的組裝是由主鏈氫鍵和側鏈相互作用(如π-π堆積、疏水相互作用和范德華)驅動。β-淀粉樣蛋白(Aβ)可以交叉β模式自組裝成低聚物或纖維絲,損傷神經(jīng)元和突觸,導致神經(jīng)退行性疾病,如老年癡呆(AD)和帕金森病(PD)。與毒性較小的Aβ1-40相比,Aβ1-42更疏水,更易聚集,被認為是AD發(fā)展的更重要因素。然而,Aβ1-42淀粉樣蛋白組裝在AD發(fā)病機制中的基本作用和重要意義尚未完全闡明。對Aβ1-42組裝的研究,有助于我們理解AD的發(fā)病機制,為診斷和干預提供潛在的靶點。例如,Aβ1-42可以通過和銅等金屬離子共聚集,產(chǎn)生reactive oxygen species(ROS),在AD中造成氧化應激。因此,靶向Aβ1-42的自組裝過程是頗有前景的治療策略。

Aβ1-42的19、20號位氨基酸FF作為其組裝核心基序,被廣泛研究并被報道可形成β結構的超分子納米結構,因而備受關注。研究FF的自組裝行為可以更好地剖析Aβ1-42的聚集發(fā)生過程。而FF與Aβ1-42的組裝行為不完全相同,這是由于Aβ1-42中的其他氨基酸會影響自組裝。氨基酸殘基如芳香基、氨基或羧基,可以通過π-π堆積力和其他相互作用(如氫鍵和范德華力)驅動并影響FF的組裝。在20種天然氨基酸中,組氨酸(His)在蛋白質(zhì)的相互作用中發(fā)揮多種作用,并可作為參與酶催化的關鍵殘基。His作為中性形式的芳香π(His)或質(zhì)子化形式的陽離子(His+),可以與其他芳香氨基酸進行π-π堆疊及H-π作用。His還可以與金屬配合調(diào)節(jié)酶的催化作用。例如,His170與血紅素中心的鐵配位,以調(diào)節(jié)辣根過氧化物酶的催化作用。His可以用作修飾或自組裝成人工酶的關鍵單元,以模擬過氧化物酶(POD)樣或過氧化氫酶(CAT)樣活性。因此,His可調(diào)節(jié)FF自組裝的納米結構,并可賦予組裝體特定的生物活性。Aβ1-42的6、13、14號位均為His,為其和19、20FF的相互作用提供了可能。同時,F(xiàn)F和His的相互作用可能會構成酶的催化活性位點,使得Aβ1-42具有納米酶的活性從而造成氧化損傷。

本研究表明,His在Fmoc-F-F二肽的組裝中具有關鍵作用,并調(diào)控其催化行為,從而為Aβ1-42催化和AD發(fā)病機制之間提供了聯(lián)系。與多數(shù)FF組裝是在有機溶劑【如二甲基亞砜(DMSO)、六氟異丙醇(HFIP)】中進行的研究不同,該工作證明了氨基酸特別是His水溶液的存在下,可將Fmoc-F-F從納米棒轉變成纖維絲(圖1)。

進一步,F(xiàn)moc-F-F(His)纖維絲表現(xiàn)出過氧化物酶(POD)活性,表明His對催化做出了重要貢獻。研究發(fā)現(xiàn),Aβ1-42纖維絲表現(xiàn)出POD活性(圖2a),其中His可能在催化中發(fā)揮作用,這是由于Aβ1-42(6His→Ala)POD活性比Aβ1-42低(圖2b)。Alphafold2預測結果表明,His/FF的活性位點可能來源于分子間的組裝,這說明Aβ1-42纖維絲可以具有多個活性位點。這種特征不同于通常在蛋白質(zhì)結構內(nèi)具有單一活性中心的傳統(tǒng)酶。此外,組裝的Aβ1-42纖維絲很難被降解,且可長期穩(wěn)定存在,因而易獲得持久的催化活性。與傳統(tǒng)的天然酶不同,Aβ1-42纖維絲或是一種天然納米酶,提供了另一種基于多肽組裝的催化模式。

研究推測,Aβ1-42纖維絲可以作為具有POD活性的天然納米酶,在AD發(fā)病機制中或存在一定作用(圖3)。His殘基有可能作為控制AD中Aβ1-42沉積和降低神經(jīng)毒性的靶點。除了AD中的Aβ1-42纖維絲外,研究在許多疾病中發(fā)現(xiàn)了大量淀粉樣蛋白聚集體,如II型糖尿病中的胰島淀粉樣多肽、甲狀腺癌中的人降鈣素、帕金森病中的α-突觸核蛋白、肌萎縮側索硬化癥(ALS)中的抗氧化酶SOD1。這些蛋白聚集體可能具有類酶活性,從而通過催化在疾病的發(fā)生發(fā)展中起到重要作用。該研究為天然納米酶的發(fā)現(xiàn)提供了新見解,以幫助科學家發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)聚集體在相關疾病中的作用。

相關研究成果以Histidine modulates amyloid-like assembly of peptide nanomaterials and confers enzyme-like activity為題,在線發(fā)表在《自然-通訊》(Nature Communications)上。該研究由中國科學院生物物理研究所和吉林大學合作完成。研究工作得到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金創(chuàng)新研究群體項目和重點項目等的支持。

 

圖1.?His調(diào)控Fmoc-F-F二肽組裝示意圖

圖2.?Aβ1-42催化活性。a、Aβ的POD活性;b、Aβ1-42突變體的POD活性。


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